gromacs续跑

gromacs中断,模拟时间延长

Posted by xiaodechao on April 9, 2021

1 gromacs模拟结束,继续跑

gmx convert-tpr -s md.tpr -extend 2000 -o md1.tpr

gmx mdrun -v -deffnm md1 -cpi md.cpt -noappend

-s md.tpr 输入生成md.tpr文件 -extend 2000 延长2000ps -o md1.tpr 输出新的tpr文件

-deffnm md1 生成的文件名

2 gromac中断,续跑

中断的任务是这样运行的:

gmx mdrun -deffnm md

在同一个文件夹下运行:

gmx mdrun -s md.tpr -cpi md.cpt -deffnm md