1 镜像分布函数
（1）生成索引文件
gmx make_ndx -f md.gro
操作：
数字 & a 原子名
添加分子某一原子添加到索引文件。
按q退出保存。
（2）径向分布函数
gmx rdf -f md.xtc -n index.ndx -cn xxx.xvg
-f md.xtc 输入md生成文件
-n index.ndx输入索引文件
-cn 输出周围离子数目
2 密度分布
（1）索引文件（同上）
（2）z轴密度分布
gmx density -f md.trr -n index.ndx -s md.tpr -d z -o density.xvg
-f md.trr输入trr文件
-n index.ndx 输入索引文件
-s md.tpr输入tpr
-d z分析方向
-o density.xvg 输出文件
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